Bonjour,
Par chez moi, les poutres qui traversent un mur, c'est peu fréquent, et c'était souvent gardé pour les zones 'moins visibles' d'une bâtisse. La majorité des cas, on pose la poutre sur le parement intérieur du mur et le parement extérieur cache la poutre. Bref ce n'est pas la question ici.
Un enduit chaux NHL de 2cm d'épais, bien serré est considéré comme étanche à l'eau liquide. Mais il permettra la respiration si besoin, bien que le bois soit sec je suppose ! Sinon, deux briques à chant, une pierre plate etc... selon la façade et matériaux en place.
J'ai vu sur des façades de bretagne ou normandie une petite ardoise ou pierre plate qui fait une casquette pour protéger la pièce en bois de la pluie.
cordialement
matt